本申请涉及一种神经元计算机操作系统的资源映射方法和装置，其中，该方法包括：获取待运行的应用；将硬件的运行资源抽象为二维网格；基于最大空矩形法将空闲计算核心划分为矩形核心集合并确定最匹配的核心集合；基于硬件中各计算核心之间的脉冲通信代价、输入输出核心与计算核心之间的脉冲通信代价、二维网格中全部计算核心所占面积以及预设的经验常量构建代价函数；基于代价函数确定映射代价最小的映射方案。本申请通过神经元计算机操作系统建立准确估算映射代价的映射代价函数，通过代价函数确定映射代价最小的映射方案，为脉冲神经网络映射硬件资源，解决了相关技术中脉冲神经网络运行性能较低的问题，提高了脉冲神经网络的运行性能。