本发明公开了一种用于智能手机主板的测试方法及测试系统，包括：测试采集模块，对手机主板的运行项目进行测试，并得到测试运行数据；测试分析模块，对项目差值进行比较分析，得到每次的检测结果；测试平台，将多次重复测试的检测通过和检测不通过按照测试顺序进行排列，并获取到持续次数波动比值和中断次数波动比值，计算得到测试稳定值；影响采集模块，获取到测试环境数据、设备数据，并分别进行比较，得到环境设备信号；影响共振模块，获取到检测合格信号或检测不合格信号，进行共振分析，得到影响信号；本发明对测试的环境和设备，与检测结果进行共振分析，判断其外界环境对测试结果的影响，有效保证后续对手机主板质量进行检测的准确性。