本发明公开了一种MsPYR1‑like基因扩增、表达与亚细胞定位分析方法，属于新疆野苹果种子研究技术领域，包括提取种子RNA以及合成cDNA第1链；以cDNA为模板扩增基因；构建MsPYR1‑like基因载体与亚细胞定位；MsPYR1‑like基因不同层积时期表达及种子萌发分析；本方法以新疆野苹果种子为试验材料，扩增PMsPYR1‑like基因序列，对MsPYR1‑like基因生物信息学，编码蛋白进行序列特征、进化树分析；利用亚细胞定位探明其作用位置；qRT‑PCR分析新疆野苹果种子低温层积过程中的表达水平，为新疆野苹果种子MsPYR1‑like基因解除休眠作用机制提供了理论基础。