本发明提供一种交直流微网群的分布式主从协调控制方法及系统，属于基于柔性直流互联的交直流微网群运行控制技术领域，建立柔性直流互联交直流微网群分布式二次控制器；建立交直流微电网等效下垂模型；建立柔性直流互联变换器的本地控制器；交直流微电网归一化；建立分布式主从集群协调控制器。本发明在系统自主运行的情况下实现直流配电网母线电压恒定、参与协调的交直流微电网按最大容量比例发出有功以及交直流微网内部频率、电压恢复、功率按容量比例分配。