本发明公开了用于通航水域的浮桥结构的施工方法，包括以下步骤：S1）施工位于主桥段和引桥段之间的主墩台以及支撑引桥段的陆上墩和桥台；S2）铺设于主桥段下方的锚定组件，固定于河床面上的锚定组件，外侧的用于固定主桥段，内侧的用于固定船闸；S3）从岸侧至水侧，依次吊装定位并浮运安装浮箱墩，相邻的浮箱墩以及浮箱墩与主墩台之间通过钢桁架连接，连接张紧并固定主桥段的外侧的锚定组件；S4）预制的船闸整体装配后，浮运至设定位置后，连接船闸的内侧的锚定组件并张紧固定。