本发明涉及一种柔性互联开关电网电压异常耐受控制方法、设备及介质，包括以下步骤：S1、获取节点电压；S2、检测节点电压是否存在谐波分量，若是，执行S3，若否，等待下一次检测，执行S2；S3、基于节点电压，进行坐标变换；S4、基于坐标变换结果，分离出节点电压基频分量；S5、将基频分量反变换回原始坐标系下，计算节点电压倍频谐波分量；S6、将倍频谐波分量作为调制信号的一部分，叠加在含有直流与基频分量的串联变换器调制波上；S7、重复执行步骤S2‑S7，最终输出与倍频谐波分量相反的电压分量，以实现对电网电压的异常控制。与现有技术相比，本发明使得柔性互联开关不受谐波影响，提高了柔性互联开关的异常耐受性。