本发明提供了一种氟硅酸盐包覆的硅基负极材料及其制备方法和应用，涉及锂离子电池技术领域。该硅基负极材料包括由晶体硅颗粒组成的内核和由Li2SiF6组成的均匀包覆内核的氟硅酸盐包覆层；该方法采用碱性溶液对纳米硅材料进行表面氧化，再通过溶液中Li和F元素的共同作用将表面氧化层原位转化成氟硅酸盐，得到氟硅酸盐包覆的硅基负极材料，有助于形成稳定的SEI膜，减少循环过程中SEI膜的不断生成，在充放电过程中提升了负极材料与电解液间的界面稳定性，从而提升了电池的循环性能。本发明提供的制备方法流程短、成本低、产率高，可以大规模推广。