本发明公开一种利用酸化油废水的微生物菌剂及其制备方法和应用，属于微生物技术领域。本发明筛选分离得到一株地衣芽孢杆菌，其具有优异的解磷作用，可以将废水中的磷脂充分转化为植物可吸收的磷形态。而使用的铜绿假单胞菌可以高效的降解有机物，沙上黄杆菌具有良好的生物发酵效果，在混合发酵过程中，能够产生物表面活性剂，促进与固态吸附料的发酵效果，同时可以加强地衣芽孢杆菌以及铜绿假单胞菌的分解效果，因此三者等比例混合后，复合菌剂具有较高的降解和发酵效率。本发明提供的复合菌剂能够在好氧及兼氧条件下均有较好发酵效果，无需翻堆，简化了处理工艺，所得有机肥技术标准高于相关标准。