本发明公开了基于异形钢连轧工艺的柔性生产控制方法及系统，应用于数据处理技术领域，该方法包括：通过用户端获取第一连轧生产订单，柔性控制平台端中的工艺优化模块对第一连轧生产订单中的结构尺寸进行分析，得到最优连轧工艺决策。通过连轧生产监测模块对基于最优连轧工艺决策的连轧设备终端的连轧设备的生产控制过程进行动态监测，得到实时监测参数。根据实时监测参数对最优连轧工艺决策进行决策调整，得到实时连轧工艺决策。通过用户端获取第二连轧生产订单，完成排单生产。解决了现有技术中异形钢连轧工艺控制参数与异形钢的适配性不强，从而导致异形钢成品质量下降的技术问题。