本申请提供一种智能卡文件存储结构，其可以在实现智能卡文件数据掉电保护功能的基础上，提高大尺寸文件的写入效率，进而提高智能卡片的生产效率，同时还能在整体存储区范围实现磨损均衡。其通过交替更新目录信息块的方式，实现文件数据更新；通过随机选取可用扇区写入文件，然后将写入文件的扇区号登记到目录信息块中，整体上仅需一到两次写操作即可实现文件的创建、更新；初始化创建长文件时，只需要在目录信息块中构建长文件的文件项FILE_ITM，无需在文件数据区中为长文件实际分配存储空间，后续在更新操作时，为长文件申请可用扇区。同时，本申请还公开了一种智能卡文件管理方法。