本发明提供了一种减小MMC电容电压波动的二倍频环流幅值控制方法及系统，属于直流配电网技术领域。本发明的方法包括获取模块化多电平换流器的交流侧a相电流相位初值；获取模块化多电平换流器的并网点a相基频调制电压；确定模块化多电平换流器a相桥臂二倍频环流相角初值目标值，根据该目标值对二倍频环流幅值进行优化控制。本发明通过优化MMC二倍频环流幅值减小MMC子模块电容波动，进一步减小MMC电容配置实现MMC紧凑化，既保留了MMC拓扑结构的优势，又操作简单，经济性好，兼容性优。