本发明公开一种小样本调制识别方法、系统、电子设备及存储介质，涉及通信信号的调制识别技术领域。所述方法包括：获取水下通信信号；对水下通信信号进行信号重建处理，得到增强信号；根据增强信号和ResDLNN模型确定信号识别分类结果；ResDLNN模型包括依次连接的输入层、残差稠密卷积块、长短期记忆层和输出层；残差稠密卷积块是基于残差网络结构和稠密网络结构，由两个具有128个核的一维卷积层、一个Dropout层和一个最大池化层构建的；残差稠密卷积块用于提取信号中的特征；长短期记忆层用于提取信号特征中的时域信息。本发明能够利用深度学习，在少量调制信号样本的基础上提高调制信号的分类性能。