本发明属于微波干燥设备技术领域，具体是一种用于微波干燥设备的智能控制系统，包括处理器、物料输入检测模块、微波干燥运行监测模块、设备运行风险预测模块和智能调控模块，处理器与物料输入检测模块、微波干燥运行监测模块、设备运行风险预测模块以及智能调控模块均通信连接；本发明是通过物料输入检测模块实现对物料输入状况的准确检测并自动调控传送效率，微波干燥运行监测模块对微波干燥设备进行运行监测分析，在判定运行不合格信号时加强对微波干燥设备的运行管控，微波干燥设备的后续运行更加稳定，通过将物料输入检测反馈和设备运行监测反馈相结合以有效保证对物料的干燥效率干燥效果。