本发明公开了用于植物空心胶囊储存的环境控制方法及系统，属于智能控制领域，其中方法包括：读取产线的控制策略，建立基础配置特征集；建立员工特征集，进行员工影响辐射模拟，生成影响辐射模拟结果；记录控制策略的策略触发，执行植物空心胶囊生产分类，记录初始分类标签；进行分区域的胶囊存储，将初始分类标签输入决策控制器，生成温湿度的决策控制信号；在胶囊存储分区布设监测传感器，当实时监测结果触发决策控制信号时，则生成环境调整数据，控制环境调整设备完成环境控制。本申请解决了现有技术中植物空心胶囊储存环境无法实现动态精细化控制的技术问题，达到了根据不同批次胶囊特点实现对储存环境动态精细化控制的技术效果。