发明授权
- 专利标题: 一种基于多组学的植物表型预测方法和装置
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申请号: CN202311269915.8申请日: 2023-09-28
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公开(公告)号: CN116992919B公开(公告)日: 2023-12-19
- 发明人: 吴翠玲 , 徐晓刚 , 冯献忠 , 于慧 , 王军 , 韩强 , 何鹏飞 , 曹卫强 , 马寅星 , 李萧缘
- 申请人: 之江实验室 , 中国科学院东北地理与农业生态研究所
- 申请人地址: 浙江省杭州市余杭区中泰街道科创大道之江实验室
- 专利权人: 之江实验室,中国科学院东北地理与农业生态研究所
- 当前专利权人: 之江实验室,中国科学院东北地理与农业生态研究所
- 当前专利权人地址: 浙江省杭州市余杭区中泰街道科创大道之江实验室
- 代理机构: 杭州求是专利事务所有限公司
- 代理商 邱启旺
- 主分类号: G06N3/042
- IPC分类号: G06N3/042 ; G06N3/0464 ; G06N3/0499 ; G06N3/084 ; G16B40/00 ; G06F18/213 ; G06F18/22
摘要:
本发明公开了一种基于多组学的植物表型预测方法和装置,该方法基于图卷积神经网络,将多组学如基因组、转录组、代谢组的数据作为图节点,不同组学之间的关联程度作为图的边来构建每个植株的图结构数据,将构建的图结构数据输入图卷积神经网络中,提取节点特征,通过Transformer网络更新节点特征,节点特征拼接后输入全连接层,输出表型预测值,利用整个图结构融合多组学特征实现表型的预测。本发明创新性的利用图卷积神经网络结合Transformer网络实现基因到表型的预测,并利用多组学构建图结构融合多组学数据实现精准表型预测,在一定程度上解决只用单一组学表型预测不准的问题,
公开/授权文献
- CN116992919A 一种基于多组学的植物表型预测方法和装置 公开/授权日:2023-11-03