本发明公开了一种洪水风险推演方法、系统及电子设备，涉及洪水风险推演技术领域。本发明包括将河道水面高程DEM与河网地形DEM进行作差处理，得到待研究区域的洪水特征淹没分布栅格图；对洪水特征淹没分布栅格图进行像元值放大处理，再进行栅格转矢量操作，得到洪水特征淹没分布矢量图；基于空间地理数据将社会经济特征分布图、土地利用分布图、三维影像和洪水特征淹没分布矢量图进行叠加处理，得到洪水淹没分布专题图；基于洪水淹没分布专题图，制定待研究区域的防洪措施。本发明通过基于空间地理数据将社会经济特征分布图、土地利用分布图、三维影像和洪水特征淹没分布矢量图进行叠加处理，能够提高大范围长距离复杂河网的洪水风险推演精度。