本发明公开了一种车站主体顶板接缝的防水结构，包括主体侧墙和主体顶板，所述主体侧墙和主体顶板相互垂直，所述主体顶板的上表面与主体侧墙之间固定连接有多个上支撑板，所述主体顶板的下表面与主体侧墙之间固定连接有多个下支撑板；所述主体顶板的上表面与主体侧墙的连接处设置有上弧形硅胶片，所述主体顶板的下表面与主体侧墙的连接处设置有下弧形硅胶片，所述下弧形硅胶片内安装有软管。通过本发明结构，当车站的主体顶板发生下沉问题，主体侧墙和主体顶板的连接处依旧能够通过上弧形硅胶片和下弧形硅胶片保持接缝处的密封效果，通过判断红外线接收器接收红外线信号的位置，来判断相对错位的程度。