本发明公开了一种基于动态孤岛划分的主动配电网故障恢复方法和系统，所述方法包括：基于配电网内联络线的建设情况和配电网区域内各发电机的运行特性，建立主动配电网运行连通分量模型；根据主动配电网运行连通分量模型，建立考虑网络结构限制与微网控制器限制的负荷恢复模型；求解所建立的模型，获取故障时间内配电网的动态孤岛划分方案；建立配电网线性潮流模型，并根据动态孤岛划分方案，求解配电网线性潮流模型，得到各发电机的发电规划，结合动态孤岛划分方案进行故障恢复。本发明可以协同分段开关、断路器与分布式电源，实现配电网在大停电后的快速恢复，统一配电网故障恢复中的孤岛划分与网络重构过程，提升配电网运行弹性。