本发明涉及数据加密存储技术领域，具体涉及一种结合文档数据的指纹加密存储方法，包括：获取文档数据以及指纹数据，对文档数据以及指纹数据分别进行分割，得到文字区块图以及指纹二值数据段，设置二值密钥阵列，获取文字区块图中黑色像素点的笔画方向，根据笔画方向获取每个像素点的可嵌入性，根据所有文字区块图中每个像素点的可嵌入性以及像素值获取权重矩阵中每个位置的权重占比，更新权重矩阵，根据二值密钥阵列、权重矩阵对每个文字区块图嵌入指纹二值数据段，得到一级加密文档，对一级加密文档进行加密存储以及防篡改验证。本发明防止了文档数据被篡改，确保了文档数据的完整性，同时嵌入的指纹数据对文档数据中文字的影响最小。