本发明公开了一种复合生物基阻燃无纺布及其制备方法，该制备方法包括如下步骤：S1、将聚酰胺纤维和海藻酸盐纤维共混后压缩，得到聚酰胺/藻酸盐混纺无纺布；S2、将聚酰胺/藻酸盐混纺无纺布浸入磷酸酯阻燃剂溶液中，进行接枝反应；S3、对反应后的无纺布进行固化干燥、洗涤、干燥即得。本发明采用海藻酸盐纤维与磷酸酯类阻燃剂对聚酰胺纤维无纺布进行双重阻燃，另外，由于阻燃剂在高温下分解产生磷酸物质，从而加速了纤维素纤维向碳的转化，进而减少了纤维的燃烧分解和易燃挥发性气体的产生，抑制可燃气体的释放，以防止海藻酸盐纤维的燃烧，二者产生协同阻燃效果。处理后的无纺布具有出色的阻燃性和热稳定性，且燃烧后残炭的形貌保存完好。