本发明公开了一种自动化设备巡检系统，包括：控制终端、中心服务设备和巡检网关设备；控制终端，用于生成巡检执行脚本、巡检结果整理脚本以及巡检结果判断脚本，并发送至中心服务设备；中心服务设备，用于将各个脚本封装成一执行命令，并发送至所述巡检网关设备；巡检网关设备，用于根据巡检执行脚本，对待检测设备进行巡检，获取巡检数据；接着根据巡检结果整理脚本对巡检数据进行整理，生成巡检数据表，以及根据巡检结果判断脚本，对巡检数据进行异常判断，并获取异常判断结果；最后根据巡检数据表和异常判断结果，生成的巡检报告，并发送回中心服务设备。通过实施本发明，能够对各待检测设备进行自动巡检，以提高运维工程师的运维工作效率。