本发明提供多相体系连通性判断的区域分割高效搜索方法及系统，在采用递归算法对多相体系进行连通性判断的基础上，提出了区域分割搜索方法，把整体区域沿某一方向分割成数等分，按照特定的顺序和一定的方法逐个分析小区域的连通性，在此基础上判断整体的连通性，能够大幅降低区域面积大、孔隙数量多、连通关系复杂情况下连通性判断过程中的搜索次数。区域分割高效搜索方法包括：将试样二维模型整体区域按照预定方向分成m个子区域，m≥2，依次将各个子区域、各边界编号；将各子区域的两条边界中位于外侧的边界记为外边界，靠近区域中心的边界记为内边界，按照特定的方向和顺序逐个搜索子区域的连通情况；根据搜索结果确定试样二维模型的连通性。