本申请公开了一种体视荧光显微镜模块，包括安装壳、LED荧光光源系统、荧光滤光系统和控制组件；LED荧光光源系统、荧光滤光系统和控制组件均安装于安装壳；安装壳安装有聚光镜；安装壳开设用于连接目镜的第一接口和用于连接变倍体的第二接口；LED荧光光源系统包括多组不同波段的LED灯珠、荧光滤光系统包括多组滤光镜片组，多组LED灯珠与多组滤光镜片组一一对应设置；控制组件连接有用于将多组不同波段的LED灯珠和多组滤光镜片组进行同步切换的同步切换组件；同步切换组件切换到位后，其中的一组LED灯珠的光源中心、对应的其中一组滤光镜片组的中心和聚光镜的中心在同一轴线上。本申请具有方便快速、且无需多次切换荧光滤光系统和照明光源系统的效果。