本发明涉及基因工程技术领域，具体涉及新型布鲁氏菌菌壳疫苗及其应用。本发明提供了缺失尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶UGPase基因且包含噬菌体裂解蛋白E基因的新型布鲁氏菌及其制备方法，进一步提供了包含所述新型布鲁氏菌的新型布鲁氏菌菌壳疫苗及其制备方法。与现有弱毒疫苗和传统疫苗相比，本发明提供的新型布鲁氏菌菌壳疫苗在保留完整抗原结构的前提下提高了安全性、免疫保护效果好、生产工艺简单，且可实现鉴别诊断自然感染和疫苗免疫布鲁氏菌的动物。