本发明公开了一种兽用抗肠道细菌感染的组合物制剂及其制备方法，该组合物制剂包括以下重量份原材料制备而成：40‑60份的酒糟、5‑8份的陈皮、3‑5份的黄连、8‑12份的石榴皮、5‑9份的五倍子、5‑10份的柴胡、5‑10份的大黄、10‑15份的甘草；该组合物制剂不仅通过针对性的优化原料药种类及其配比，使各原料药之间具有了协同增效的作用，从而实现对畜禽胃肠道大多数有害细菌的显著抑制效果，显著降低了畜禽胃肠道细菌感染的风险；而且还通过利用酒糟作为载体，在辅助抗菌的同时，能延长原料药在胃肠中的滞留时间，从而使抗菌效果持续时间更长，提高了组合物制剂的抗细菌感染效果；该组合物制剂既能有效实现肠道的抗菌效果，又能降低喂养成本，适合大规模推广应用。