本发明涉及医疗数据处理技术领域，提出了一种临床试验的数据管理及逻辑核查方法及其医疗系统，包括：获取若干病例的临床试验数据；将若干病例的临床试验数据根据每个病例的病例试验信息进行分类，根据每个类别中不同字符串的分布分别构建每个类别的原始字典，根据每个类别的原始字典中不同字符串的重复程度获取每个类别的初始字典；根据每个类别的初始字典中字符串在类别中临床试验数据中与后缀字符组成的字符串组合的语义信息，迭代判断后缀字符个数并更新字典，根据更新的字典完成对每个类别的临床试验数据的压缩；将压缩后的临床试验数据传输到服务器中进行存储。本发明旨在解决传统LZW算法对临床试验数据压缩率较低且压缩过程较慢的问题。