一种故障扰动分析方法，包括：获取热量输运系统的初始物性参数；基于所述初始物性参数结合预先构建的热量输运系统的整体动态热功率流模型，利用分段分析法确定故障扰动在热量输运系统的输运特性；其中，所述热量输运系统的整体动态热功率流模型是基于热量输运系统中各个有影响的设备的动态热功率流模型构建的；本发明基于设备热量传递过程确定的模型可以得到更准确的供热扰动和故障在热量输运系统中的输运分布特性，为制定抗故障扰动智慧控制策略提供了必要的依据。