本申请提供一种极端条件下水轮发电机接地故障穿越方法及系统，属于水轮发电机运行维护技术领域。所述方法包括：获取水轮发电机中性点的接地电流值以及水轮发电机接地故障点处对应的单相机端的电容电流值；基于所述水轮发电机接地故障点处对应的单相机端的电容电流值和所述水轮发电机中性点的接地电流值，计算水轮发电机故障点的接地电流值；基于所述水轮发电机故障点的接地电流值，按照设定的策略控制水轮发电机执行相应的故障穿越操作。本申请实施例在水轮发电机发生单相接地故障时，能够按照设定的策略控制水轮发电机执行相应的故障穿越操作，优化了水轮发电机在极端条件下的运行状态，保障极端情况下的能源供应。