本发明公开了一种荧光扫描装置，属于荧光扫描技术领域。包括输送用荧光染料标记的活细胞的传输流道，所述传输流道包括流通管和设置于所述流通管内腔的进样管；所述流通管内填充有鞘液，所述鞘液提供保持细胞活性、使细胞具备移动的液体环境，并约束从进样管排入流通管内的活细胞保持单列移动；所述流通管内设置有照射区，所述照射区靠近所述进样管输出端，激光照射经过所述照射区的活细胞，激发其产生荧光，并通过接收器接收活细胞产生的荧光。从出口通道排出的细胞不会脱离液流轴线方向，且保证每个细胞通过激光照射区的时间相等，从而通过荧光成像得到准确的细胞信息，从而得到活细胞的更加实时准确的生物信息，使得检测结果更加准确。