本发明提出一种基于跨链区块链的不同部门信息安全交互的方法及系统，在城市规划领域的各区块链，以各自分布式节点中的中心化服务器作为各自的跨链网关；跨链网关接收所属区块链中节点的跨链请求消息；跨链网关基于自身中心化服务器与客户端架构的通信连接，验证所述节点的身份以及访问目标区块链的权限；跨链网关产生私钥并发给所述节点，所述节点使用私钥生成公钥、数字签名；目标区块链使用收到的所述公钥和数字签名验证跨链信息的完整性。本发明结合城市规划领域的中心化功能和区块链的去中心化能力，提高不同部门信息交互的安全性。