本公开属于综合能源规划技术领域，具体涉及一种综合能源系统的资源优化配置方法及系统，包括：确定综合能源系统的参与主体，构建资源优化配置模型；结合综合能源系统运行过程中资源优化配置影响因素，确定各个影响因素指标；基于影响因素指标，获取参与主体的综合影响程度评分及其权重；根据所述综合影响程度评分及其权重，计算参与主体的影响因子；根据所得到的参与主体影响因子，计算资源优化配置修正因子，结合所构建的资源优化配置模型，完成综合能源系统的资源优化配置。