本发明公开一种碳纸疏水处理装置和方法，碳纸疏水处理装置包括依次衔接的放卷组件、疏水组件、烘干组件和收卷组件，其中，疏水组件包括浸渍槽、除泡挡板、传送辊和碳纸刮刀，浸渍槽具有用于盛装疏水液的容纳腔；除泡挡板安装于容纳腔内并将容纳腔分隔为除泡腔室和疏水腔室，除泡腔室邻近放卷组件，疏水腔室邻近烘干组件，除泡挡板和容纳腔的底面之间构成连通除泡腔室和疏水腔室的过液通道；传送辊安装于疏水腔室内并用于与碳纸传动相连；碳纸刮刀有两个并均安装于浸渍槽的下游，两个碳纸刮刀之间形成供碳纸通过的除泡间隙。本发明提供的碳纸疏水处理装置具有降低碳纸上粘附的气泡数量，提高疏水后碳纸品质的优点。