本发明提供了一种放射治疗系统及计算机可读存储介质。所述放射治疗系统中，在所述放疗设备处于在线状态且进行放射治疗之前，利用所述成像设备采集多时相的覆盖靶区的成像数据，重建多时相的3D图像，并获取与所述多时相的3D图像同步的多个时相的时相表征数据，建立一关联模型，所述关联模型体现了每个时相的时相表征数据和3D图像的对应关系，在所述放疗设备进行当次在线治疗时，利用所述关联模型监控所述靶区的实时位置。相对于采用离线模型获取靶区实时位置，可以提高靶区实时位置的监控精度，尤其适用于容易受到生理运动影响的肿瘤区域的放射治疗。所述计算机可读存储介质具有类似的优点。