本发明提供了一种湿法脱硫系统运行优化方法和装置，方法包括：以脱硫浆液品质参数和脱硫入口SO2质量浓度作为运行工况划分依据来对脱硫运行工况进行划分；对历史运行数据进行稳态工况识别和筛选得到历史稳态工况运行数据；对各划分工况下的历史稳态工况运行数据依据脱硫成本进行核算排序，挑选预设比例的成本最低的运行数据加入经济性运行数据库；判断当前湿法脱硫系统实时运行工况是否为稳定工况；响应于当前湿法脱硫系统实时运行工况为稳定工况，对湿法脱硫系统运行进行优化。本发明将脱硫入口SO2质量浓度和脱硫浆液品质为工况划分依据，更好地对脱硫工况进行合理划分，并在具体的优化处理中保证最终的脱硫优化方案更加与实际情况贴合。