本发明提供了一种劣质重油的加工方法及系统，所述方法包括：将劣质重油、催化剂与氢气充分混合后进行浅度加氢裂化反应，对反应所得产品进行气液分离后得到液相产品；将所述液相产品与复合絮凝剂混合后进行连续沉积，以分离得到溢流物料和底流物料；对所述溢流物料进行分馏，得到未转化油；将未转化油甩出尾油后的其余部分、催化剂与氢气充分混合后进行深度加氢裂化反应，对反应所得产品进行气液分离后得到液相产品，再对所述液相产品单独进行分馏或者与所述溢流物料一起进行分馏，得到轻质油品。该方法及系统在确保产品收率的同时，还可大幅度减少浆态床加氢反应器以及后续分馏塔等设备出现结焦堵塞的风险，延长装置的操作稳定性和运行周期。