本发明提供了一种考虑高比例新能源不确定性的电力系统优化运行方法，所述方法包括：建立电力系统运行模型；建立新能源模型与储能模型；建立确定性优化调度模型；其中，所述确定性优化调度模型以最小化系统总成本为目标函数；基于所述目标函数，建立不确定性优化调度模型；输入源电力系统数据、设备参数及运行参数至所述不确定性优化调度模型，利用求解器进行求解，获取调度运行结果。本发明属于多源电力系统优化运行技术领域，通过本发明提供的方法建立的不确定性优化调度模型，应用于新能源为主体的新型电力系统中，可以提高电网对太阳能和风能的消纳能力，同时配合火电机组参与调峰，有效维护系统的安全稳定，提升系统运行的经济效益。