本发明提供了一种电堆水含量的调控方法及其应用，所述调控方法包括：测量气流量调整后电堆的瞬态输出电流，测量气流量调整后电堆的稳态输出电流，计算得到瞬态输出电流相对于稳态输出电流的第一差值比例的第一绝对值；测量气压调整后电堆的瞬态输出电压，测量气压调整后电堆的稳态输出电压，计算得到瞬态输出电压相对于稳态输出电压的第二差值比例的第二绝对值；将第一绝对值或第二绝对值与设定比较值进行对比；若所述第一绝对值或所述第二绝对值大于所述设定比较值，则需进行电堆的补水或排水，反之，无需进行电堆的补水或排水。本发明提供的电堆水含量的调控方法无需额外引入复杂的设备、调控成本较低、调控难度较低且调控准确度较高。