本发明公开一种适用于海浪数值模式的MPI虚拟图拓扑通信方法及系统，涉及通信技术领域，根据海浪数值模式的网格邻接关系和网格分区表，确定每一进程的接收进程编号、接收进程数量、接收网格编号和接收网格数量，进一步确定每一进程的发送进程编号、发送进程数量、发送网格编号和发送网格数量，以便根据所有进程的接收进程编号、接收进程数量、发送进程编号和发送进程数量构建虚拟图通信拓扑。在海浪数值模式需要进行数据通信时，基于虚拟图通信拓扑调用一次MPI虚拟图通信拓扑接口，即可完成各个进程间的通信，相较于点对点通信，通信效率显著提高。