本发明公开了一种配电网数字孪生空间数据组织方法及系统，融合了电气拓扑和三维空间数据，通过端子号匹配实现电气拓扑的融合，相比传统的融合方式更加精确，同时叠加了电网设施经纬度信息，满足地理信息计算的需要；遍历更加高效，采用拓扑遍历的方式，相比采用依赖ID编号进行关联查询的方式，更加快速高效，能够支撑大规模的数字孪生业务分析；融合并接入了电网量测数据，通过设置定时轮询器，实时更新量测数据，保证了数字孪生体的实时、可用性。本发明通过将电气拓扑融入电网数字孪生体，并将量测信息通过设备对应关联，为数字孪生的应用提供了更加丰富、可用的数据基础。