本发明属于植物遗传育种领域，具体涉及一个与花生产量性状相关的SNP标记及其应用。本发明利用全基因组关联分析，获得控制产量相关重要SNP位点，该位点位于花生16号染色体的139632313处（Arahy.16_139632313），该位点多态性表现为该处核苷酸为G或A。当花生基因组序列中Arahy.16_139632313处基因型为GG时，该花生为高产材料，当花生基因组序列中Arahy.16_139632313处基因型为AA时，该花生为低产材料。该SNP标记可用于（1）花生分子标记辅助育种；（2）鉴定花生种质资源产量性状；（3）花生遗传图谱构建。