本发明公开一种纺锤形赖氨酸芽孢杆菌及其应用，属于微生物技术领域。本发明提供的纺锤形赖氨酸芽孢杆菌，命名为KBD‑5，该菌种保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏编号为CGMCC No.26146，保藏日为2022年11月14日。所述KBD‑5菌株，对烟草花叶病毒具有优异的抑制活性，且具有较好的无机硒还原能力，同时还能够促进植物的生长发育，因此，可将KBD‑5菌株制备成菌剂或者纳米硒活性菌液，用于植物抗病性研究，具有显著的应用价值。