本发明公开了一种风电机组变流器直流母线并联电池储能的控制方法及系统，其中方法包括：在机侧变流器控制环节，将风电机组中发电机的转矩作为控制输入，通过PI控制环节获取机侧控制信号；在网侧变流器控制环节，将电网的功率指令作为控制输入，通过功率外环PI控制与电流内环PI控制，获取网侧控制信号；在电池储能控制环节，将直流母线电压作为控制输入，基于变流器直流母线电压的测量值与直流母线额定电压的差值，通过PI控制获取电池储能控制信号；基于所述机侧控制信号、所述网侧控制信号以及所述电池储能控制信号对风电机组变流器直流母线并联电池储能进行控制。