本发明公开了一种聚丁二酸丁二醇酯树脂及其制备方法，属于高分子材料技术领域。聚丁二酸丁二醇酯树脂的制备方法，包括如下步骤：S1.酯化反应：将1,4‑丁二醇、丁二酸、催化剂、稳定剂和抑制剂混合酯化反应，得到酯化物；S2.聚合反应：将S1的酯化物聚合反应，得到聚丁二酸丁二醇酯树脂；其中，抑制剂为4‑[(四氢化‑2‑呋喃基)氧基]‑1‑丁醇。本发明通过加入特定的抑制剂，有效抑制了酯化反应过程中1,4‑丁二醇生成四氢呋喃的副反应，显著降低了四氢呋喃的产出率，能够使得四氢呋喃的产出率降低到25％以下。而且聚合物中残留的THF含量≤500ppm。