本发明涉及作物育种技术领域，具体公开了一种重离子束辐照诱变的薰衣草育种方法，其包括以重离子束辐照从薰衣草幼苗上获取的幼嫩枝条的步骤。本发明的育种方法采用幼嫩枝条，其上的细胞处于有丝分裂的旺盛时期，代谢加快，此时进行重离子束辐射辐照处理，提高了突变率。且枝条幼嫩、含水量高，较低的辐照剂量可获得较高的突变率，进而节约辐照时间。本发明利用快速无性扦插繁殖结合人工自交的方法筛选稳定突变株，从而缩短了育种周期；后代变异材料丰富，有益类型多，可筛选出花期变化、穗型变异、矮化、花色变异等有研究价值的突变体，为培育薰衣草新品种提供了一条新的技术途径。