本公开提出一种基于主成分分析法的电池故障判断方法和系统，该方法包括获取无故障电池历史运行数据，基于无故障电池历史运行数据构建数据矩阵；构建主成分分析模型，主成分分析模型基于输入的数据矩阵得到协方差矩阵，然后对协方差矩阵进行奇异值分解从而输出主成分和剩余成分的投影矩阵；获取目标电池的实时运行数据，基于实时运行数据、主成分及剩余成分投影矩阵和显著性水平计算得到目标电池的霍特林统计量、平方预测误差及对应的控制限值；基于霍特林统计量、平方预测误差及对应的控制限值判断目标电池是否发生故障；若目标电池发生故障进而确定电池故障位置。根据本公开的方法，能够更加准确地判断电池故障及故障发生位置。