本发明公开了一种非对称密钥的认证方法、系统及可读存储介质，方法包括：认证平台发送第一终端证书和第一服务端证书到终端；终端接收到后获取第一报文发送给服务端；服务端转发第一报文到认证平台；认证平台接收第一报文，根据第一报文中的序列号获取第二终端证书和第二服务端证书进行密钥协商得到第一会话密钥，根据第一会话密钥对第一随机数和第二随机数加密得到第一随机密文，发送第二报文到服务端；服务端转发第二报文到终端；终端接收第二报文进行密钥协商得到第二会话密钥，基于第二会话密钥对第一随机数和第二随机数加密得到第二随机密文；终端比较第一随机密文和第二随机密文。以提高认证速度，可应用于非对称密钥的认证领域。