本发明公开了一种耐盐的沼泽红假单胞菌及其构建方法和应用。所述沼泽红假单胞菌是通过敲除类胡萝卜素合成途径相关基因crtD，先获取重组质粒pJQ200SK‑ΔcrtD，并与野生型R.pal CGA009接合后，获得耐盐的沼泽红假单胞菌。本发明构建耐盐的沼泽红假单胞菌的方法耗时短、操作简单，该方法对传统类胡萝卜素合成途径进行改造，积累了类胡萝卜素合成途径中的产物Rhodopin，进而快速提高了R.pal的耐盐能力，有利于扩大R.pal在污水处理等领域的应用范围。