本发明属于火力发电机组自动控制技术领域，尤其涉及一种燃煤机组灵活性调峰克服给水流量波动控制方法。包括：燃煤机组灵活性调峰过程中，DCS控制逻辑根据蒸汽流量运行区间值、给水流量控制偏差变化率递进式调整给水流量PID调节器的增益值和积分时间；增加给水泵运行状态监测模块，判断2台运行给水泵中1台跳闸，造成给水流量波动，连锁关闭运行给水泵的再循环阀门，同时超驰增加运行给水泵出力；增加省煤器给水旁路状态监测模块和省煤器给水旁路调节阀门速率限制模块，依据省煤器给水旁路状态动态调整给水流量PID调节器增益值和积分时间。通过现有燃煤机组分散控制系统DCS协调控制系统，实时性好，现场调试过程简单，便于工程实现。