本发明公开了一种大规模电网新能源机组的电磁暂态自动建模方法及系统。其中，方法包括：启动新能源场站自动建模后，在需要补足相应元件时，按照元件补足规则进行单元结构元件补足；在不需要补足相应元件时或者已补足相应元件后，根据单元结构的拓扑，选择采用汇集变压器或站内升压变压器的部分漏抗参数自动生成解耦元件，通过生成的解耦元件将新能源单元结构与电网解耦；将不合理的新能源机组机端电压修正为额定电压；将由元件补足、解耦元件及机端电压修正引起的潮流结果误差进行自动校准；采用通用典型模型以及厂家模型进行新能源机组的电磁暂态建模，生成经修正并潮流校准后的单元结构电磁暂态模型，并对生成的模型进行潮流结果校核。