本发明公开了一种绿色的木质素分离方法及其产物与应用，属于木质纤维素预处理技术领域。本发明通过将L‑半胱氨酸盐酸盐和有机酸的水溶液作为预处理液，将木质纤维原料与预处理液混合进行预处理；预处理得到的悬浮液经过萃取、真空抽滤得到滤液和滤渣，滤液通过提取纯化后得到L‑半胱氨酸木质素。本发明所用溶剂来源绿色无毒，在实现木质素高效分离的同时，对木质素β‑O‑4结构进行了一定的保留，符合木质素优先分离理念，且分离出的木质素在抗紫外防晒等领域具有良好的应用。